1.中西醫(yī)結(jié)合診治婦科生殖內(nèi)分泌失調(diào)及其相關(guān)疾病的臨床及作用機制研究，深入探究無排卵型異常功血、多囊卵巢綜合征、高雄激素性血癥、高泌乳素性血癥、卵巢早衰/卵功能低下/早發(fā)性卵巢功能不全、黃體功能不全、黃素化未破裂卵泡綜合征等排卵障礙性不孕的療效機制

2.不孕不育與優(yōu)生優(yōu)育的研究 

結(jié)題及獲獎項目：

1.國家中醫(yī)藥管理局課題，功血中醫(yī)證侯量化診斷標(biāo)準(zhǔn)的研究（04-05LP49），2004.10-2009.03，10萬，課題負(fù)責(zé)人；

2.科學(xué)技術(shù)部國家十五科技攻關(guān)重點項目，“中成藥療效及安全性基本問題研究”含馬兜鈴酸中藥材及中成藥安全性評價的示范性研究（2004BA721A10），2004.11-2006.12，10萬，課題負(fù)責(zé)人；

3.人事部全國博士后管理委員會，含馬兜鈴酸中藥材及中成藥安全性評價的示范性研究的藥效學(xué)研究，中國博士后科學(xué)基金（29724），2004.10-2007.05，5萬，課題負(fù)責(zé)人；

4.國家中醫(yī)藥管理局（青年課題），調(diào)經(jīng)助卵丹治療排卵障礙性（黃體功能不健）不孕的臨床和實驗研究（93C049），1994.01-1995.12，4萬，課題組長；

5. 首都醫(yī)學(xué)技術(shù)發(fā)展基金項目，補腎活血方案在卵巢功能障礙（排卵障礙性不孕不育）中提高卵巢對促性腺激素反應(yīng)性機制的研究（SF-2009-Ⅰ-02），2010.01-2012.12，50萬，課題負(fù)責(zé)人；

6. 國家自然科學(xué)基金面上項目，補腎促卵沖劑保護卵巢儲備功能下降卵母細(xì)胞線粒體DNA氧化損傷的作用及機制研究（81674019），2017.01-2020.03，56萬，課題負(fù)責(zé)人；

7. 中國中醫(yī)科學(xué)院國際合作項目，中德合作關(guān)于補腎促卵沖劑治療卵巢早衰中卵巢顆粒細(xì)胞凋亡蛋白表達的機制研究（GH2017-02-02），2017.08-2019.08，20萬，課題負(fù)責(zé)人；

8. 科技部項目，藏醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新服務(wù)平臺公共服務(wù)體系建設(shè)項目，“人才培訓(xùn)服務(wù)”子課題（2016ZYPT01），2016-2020，58.50萬，課題負(fù)責(zé)人；

9.中國民族醫(yī)學(xué)會科研項目，補腎活血法治療腎虛血瘀型卵巢儲備功能下降所致不孕癥的臨床研究（2017KYXM-Z155-15）2017.10-2020.12，66.5萬，課題負(fù)責(zé)人；

10. 北京市中醫(yī)藥管理局北京中醫(yī)藥薪火傳承“3+3”過程項目，孫立華名老中醫(yī)工作室，2017.08-2023.08，15萬，課題負(fù)責(zé)人；

11.中國民族醫(yī)學(xué)會科研項目，補腎活血法治療腎虛血瘀型更年期睡眠障礙的臨床研究（2017KYXM-Z160-20），2017.10-2022.12，30.1萬，課題負(fù)責(zé)人；

12.中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)臨床基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所，婦科千金膠囊聯(lián)合抗生素治療盆腔炎性疾?。駸狃鲎杓鏆馓撟C）隨機、雙盲、安慰劑對照、多中心臨床研究（Z0546-3），2018.08-2025.07，303.61萬，課題負(fù)責(zé)人；

13.橫項課題，定坤丹保護卵巢功能不全卵母細(xì)胞線粒體DNA氧化損傷的作用及機制研究，2018.08-2022.08，25萬；

14.國家中醫(yī)藥管理局，中醫(yī)藥傳承與創(chuàng)新“百千萬”人才工程（岐黃工程）岐黃學(xué)者專項，2019.03-2023.03，180萬；

15.北京市自然基金課題，補腎促卵方調(diào)控氧化應(yīng)激反應(yīng)信號通路治療卵巢早衰的分子機制研究，2021.01-2023.12，20萬，課題負(fù)責(zé)人；

16.中國中醫(yī)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程，基于血管新生探討補腎促卵方調(diào)控SDF-1/CXCR4信號通路治療早發(fā)性卵巢功能不全的作用機制研究（CI2021A02406），2021.10-2024.10，20萬，課題負(fù)責(zé)人；

17. 中華中醫(yī)藥學(xué)會立項，排卵障礙性不孕癥中西醫(yī)結(jié)合診療指南（20211221-BZ-CACM），2021.12-2024.05，課題牽頭人。

18.北京市衛(wèi)生健康委員會關(guān)于開展北京市中醫(yī)婦幼名醫(yī)傳承工作室建設(shè)項目， 馬堃中醫(yī)婦幼名醫(yī)傳承工作室（2022-FYGZS-3），2022.02-2025.04，15萬，課題負(fù)責(zé)人；

19. 中國中醫(yī)藥信息學(xué)會，基于Denndla調(diào)節(jié)雄激素探討補腎促卵沖劑治療PCOS所致排卵障礙作用機制（CACMS-KY-2022003），2022.12-2025.07，課題負(fù)責(zé)人。

論文論著：共發(fā)表學(xué)術(shù)論文180余篇，SCI源期刊論文10篇，發(fā)文期刊最高影響因子5.6；

科研獎勵：第四屆婦幼健康科技獎一等獎1項；中華中醫(yī)藥學(xué)會一等獎1項；中國民族醫(yī)藥學(xué)會科學(xué)技術(shù)獎一等和二等獎各1項；中國博士后科學(xué)基金1項；中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會科學(xué)技術(shù)三等獎1項；獲中國中醫(yī)科學(xué)院科學(xué)技術(shù)獎三等獎4項；中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會第九屆婦產(chǎn)科專業(yè)委員會學(xué)術(shù)大會一等獎1項； 2023年“補腎活血法治療腎虛血瘀型卵巢儲備功能低下所致不孕癥的臨床（及機理）研究”、“中西醫(yī)治療圍絕經(jīng)期綜合征策略的探討”獲中國中醫(yī)科學(xué)院最具影響力優(yōu)秀中文學(xué)術(shù)論文。

學(xué)術(shù)兼職：

    中國民族醫(yī)藥學(xué)會婦科分會會長；中國中醫(yī)藥信息學(xué)會婦科分會第一屆會長；中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會生殖醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會和婦產(chǎn)科專業(yè)委員會副主任委員；中華醫(yī)學(xué)會指南評級RAST婦科專業(yè)委員會副主委；中國中醫(yī)藥促進會婦產(chǎn)科與輔助生殖專業(yè)委員會和婦科流派分會副會長；中國優(yōu)生優(yōu)育協(xié)會中醫(yī)婦兒食療專業(yè)委員會大會當(dāng)選副主委；世界中聯(lián)臨床研究數(shù)據(jù)監(jiān)查與決策專業(yè)委員會副會長；世界中醫(yī)藥會回醫(yī)藥專業(yè)委員會副會長；北京中醫(yī)協(xié)會女性全生命周期康養(yǎng)工作委員會主任委員。《中國中藥雜志》《中醫(yī)雜志》（中英文）《中國針灸》《針刺研究》《中華生殖與避孕》《中藥新藥與臨床藥理》《中醫(yī)學(xué)報》（中英文）《中華醫(yī)學(xué)百科全書》編委審稿專家。建有“馬堃岐黃學(xué)者工作室”、北京市“馬堃中醫(yī)婦幼名醫(yī)傳承工作室”、中華中醫(yī)藥學(xué)會“名醫(yī)名家科普工作室”。

人才項目：

國家中醫(yī)藥管理局第三批優(yōu)秀臨床人才（國家中醫(yī)藥管理局）

第七批全國老中醫(yī)藥專家學(xué)術(shù)繼承人（國家中醫(yī)藥管理局）

第六批北京市級名老中醫(yī)藥專家學(xué)術(shù)經(jīng)驗繼承工作指導(dǎo)老師（北京中醫(yī)管理局）

北京市“3+3”工程“孫立華名老中醫(yī)工作室”負(fù)責(zé)人（北京中醫(yī)管理局）

“馬堃中醫(yī)婦幼名醫(yī)傳承工作室” （北京市衛(wèi)生健康委員會）

南京中醫(yī)藥大學(xué)王琦書院江蘇分院特聘教授

浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院、浙江省健康研究中醫(yī)藥重點實驗室學(xué)術(shù)委員會主任

海南省臨床醫(yī)學(xué)中心婦科（扶持學(xué)科）建設(shè)項目顧問

山西省第二批外聘專家，“馬堃中醫(yī)婦科山西工作室

2016年12月30日享受政府特殊津貼

2017年榮獲（第三屆）人民好醫(yī)生

2018年12月24日入選首屆中醫(yī)藥傳承與創(chuàng)新“百千萬”人才工程--國家中醫(yī)藥領(lǐng)軍人才計劃（岐黃工程）岐黃學(xué)者

2021年4月入選“首都名中醫(yī)”

研究生、博士后培養(yǎng)情況：

出站博士后1名，在讀博士研究生2名，在讀碩士研究生1名

培養(yǎng)畢業(yè)博士研究生15人、碩士研究生17人

指導(dǎo)學(xué)生均就業(yè)（含升學(xué)等）18 人